Le attività sanitarie dell'Azienda sono svolte su due presidi ospedalieri:

• Ospedale Santobono, articolato in quattro padiglioni: "Santobono", "Torre", "Volano" e "Ravaschieri", sito in Napoli via Fiore, 6 con annessi locali di via Conte della Cerra;
• Ospedale Pausilipon: sito in Napoli alla via Posillipo, 226